Por esses dias passei por um problema que precisei encontrar a maneira que o OTRS guarda a senha do banco de dados.
Buscando os seus arquivos encontrei, vou postar aqui o que você precisaria fazer para simular isso.
use Digest::MD5 qw(md5_hex);
use Crypt::PasswdMD5 qw(unix_md5_crypt);
print "Sua senha: ", unix_md5_crypt("SENHA","USER"), "\n";
Simples e rápido.
Dicas de ITSM com OTOBO e Znuny 
Eu consigo atribuir esse código a uma linguagem java? Tenho um script em groovy que pega a senha que o usuário lança em um formulário de login e preciso verificar se essa senha é igual a que esta no registrada no banco do OTRS, esse código serve para isso?
As versões mais recentes não é possível fazer isso Romualdo.
E tu sabe como poderia fazer isso Junior? Pois esse é o único modo de verificar se o usuário esta cadastrado no nosso sistema e assim poderá utilizar o sistema novo também.
Obrigado pelo retorno